导演:静野孔文主演: 高山南,山崎和佳奈,小山力也,山口胜平,岩居由希子,高木涉,大谷育江,松井菜樱子,三田友子,黑田崇矢,绪方贤一,林原惠美,堀川亮,宫村优子,茶风林,汤屋敦子,置鲇龙太郎,泽木郁也,成田剑,天田益男,小山武宏,小川真司,若本规夫,广田行生,梅津秀行,麻生敬太郎,幸野善之,铃木清信,莲池龙三,土田大,津久井教生,鸟海胜美,西前忠久,三户耕三,松本大,毛利健一,甲斐田裕子,水内清光,宗矢树赖,松风雅也,柴崎幸
晴朗时节,江户川柯南(高山南配音)和毛利小五郎(小山力也配音)、小兰(山崎和佳奈配音)以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都,他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰,体验一把出海作战的感觉,期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海(柴咲幸配音)。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代,战舰上突然发现一条断掉的手臂,消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾,伺机盗取战舰上的绝密情报。为了找出隐藏的对手,柯南和灰原哀(林原惠美配音)、阿笠博士(绪方贤一配音)、服部平次(堀川亮配音)以及远山和叶(宫村优子配音)通力合作,与间谍展开连番斗智斗勇的较量……